More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1799 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
534 aa  1100    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  48.21 
 
 
1119 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  40.23 
 
 
577 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  46.37 
 
 
1088 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  48.7 
 
 
1100 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  40 
 
 
556 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  47.93 
 
 
1121 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  40.91 
 
 
601 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  39.76 
 
 
1123 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  39.73 
 
 
606 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  48.23 
 
 
1094 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  40 
 
 
1102 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  39.41 
 
 
1110 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  48.19 
 
 
1100 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  48.45 
 
 
1099 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  46.37 
 
 
1088 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  46.75 
 
 
1121 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  46.37 
 
 
1088 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  39.8 
 
 
1102 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  42.27 
 
 
1110 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  48.31 
 
 
551 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  39.8 
 
 
1139 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  48.45 
 
 
1100 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  40 
 
 
1102 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  46.56 
 
 
1093 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  40.78 
 
 
1130 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  39.09 
 
 
1112 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  46.37 
 
 
1088 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  47.47 
 
 
1088 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  47.38 
 
 
1108 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  46.37 
 
 
1093 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  46.37 
 
 
1088 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  39.88 
 
 
567 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  45.69 
 
 
1111 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  40.12 
 
 
1114 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  46.51 
 
 
598 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  46.63 
 
 
553 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  45.62 
 
 
1100 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  46.35 
 
 
1136 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  44.82 
 
 
1092 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  47.38 
 
 
1113 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  45.97 
 
 
572 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  47.15 
 
 
1137 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  48.03 
 
 
548 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  46.79 
 
 
572 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  45.08 
 
 
1104 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  45.71 
 
 
572 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  44.95 
 
 
1152 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  47.15 
 
 
1137 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  45.97 
 
 
553 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  37.09 
 
 
588 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  46.25 
 
 
598 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  47.15 
 
 
1137 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  38.8 
 
 
682 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  45.85 
 
 
1164 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  45.85 
 
 
1164 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  39.44 
 
 
596 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  47.18 
 
 
1101 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  46.39 
 
 
596 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  40.6 
 
 
1116 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  39.13 
 
 
1098 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  46.39 
 
 
596 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  45.66 
 
 
1108 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  46.89 
 
 
1137 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  40.4 
 
 
1116 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  37.55 
 
 
1115 aa  363  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  47.55 
 
 
1100 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  46.89 
 
 
1137 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  46.41 
 
 
1108 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  45.85 
 
 
1154 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  46.37 
 
 
1138 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  39.32 
 
 
591 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  45.85 
 
 
1160 aa  362  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  45.85 
 
 
1154 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  46.63 
 
 
1108 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  46.48 
 
 
1131 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  45.74 
 
 
585 aa  361  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  46.48 
 
 
1131 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  46.48 
 
 
1131 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  46.48 
 
 
1131 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  46.48 
 
 
1131 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  46.02 
 
 
1098 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  45.2 
 
 
1100 aa  360  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  45.94 
 
 
1105 aa  359  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  41.09 
 
 
1142 aa  359  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  46.21 
 
 
1131 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  45.5 
 
 
1098 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  45.45 
 
 
1100 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  45.41 
 
 
601 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  39.22 
 
 
1099 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  45.5 
 
 
1100 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  40.87 
 
 
1109 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  37.5 
 
 
591 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  44.04 
 
 
1094 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  45.29 
 
 
1105 aa  355  7.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  44.86 
 
 
1105 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  38.68 
 
 
610 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  38.4 
 
 
562 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  38.16 
 
 
551 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  44.9 
 
 
1113 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>