More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1788 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  100 
 
 
311 aa  630  1e-179  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  61.94 
 
 
306 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  56.45 
 
 
309 aa  363  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  40.26 
 
 
306 aa  228  9e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.26 
 
 
324 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  40.38 
 
 
311 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  35.58 
 
 
310 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  34.94 
 
 
310 aa  193  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 
310 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.9 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  33.99 
 
 
311 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 
303 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  35.05 
 
 
312 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  32.57 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 
312 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 
303 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  33.97 
 
 
312 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  32.68 
 
 
311 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
303 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  30.59 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  29.9 
 
 
322 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 
305 aa  162  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  31.94 
 
 
320 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 
332 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  32.8 
 
 
312 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 
326 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
310 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 
311 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.13 
 
 
303 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  29.68 
 
 
303 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
306 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
306 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
306 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 
310 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 
310 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 
307 aa  154  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 
312 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 
315 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  30.94 
 
 
350 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 
315 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  30.36 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  30.36 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  30.69 
 
 
310 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  30.36 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
309 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 
302 aa  149  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
309 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
309 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
310 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
310 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
310 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  30.36 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  30.69 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  28.3 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.85 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 
325 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.41 
 
 
300 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.57 
 
 
320 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.66 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  29.03 
 
 
303 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  31.75 
 
 
318 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  27.1 
 
 
303 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  31.68 
 
 
315 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  28.25 
 
 
308 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  30.07 
 
 
310 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  30.91 
 
 
306 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  29.28 
 
 
339 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  29.35 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  27.1 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  27.53 
 
 
305 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  29.03 
 
 
313 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.77 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.77 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  29.7 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  29.7 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 
324 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 
324 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 
324 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  29.71 
 
 
310 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  29.81 
 
 
308 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  28.06 
 
 
317 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  27.27 
 
 
330 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  29.45 
 
 
312 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  30.1 
 
 
316 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  29.18 
 
 
310 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 
316 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>