220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1760 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1760  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.178826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0097  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  55.3 
 
 
220 aa  250  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000599373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2959  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.41 
 
 
226 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2642  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.93 
 
 
226 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1245  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.98 
 
 
226 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0325404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1057  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.98 
 
 
226 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1460  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  47.62 
 
 
222 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1420  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.58 
 
 
222 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.29 
 
 
541 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  0.0000000458611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16340  L-serine ammonia-lyase, beta subunit  42.59 
 
 
218 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000548669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.54 
 
 
220 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.19 
 
 
552 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  35.34 
 
 
549 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1332  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.67 
 
 
221 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385667  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1507  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  50 
 
 
220 aa  165  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000296361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0988  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.75 
 
 
220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3971  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.55 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  39.55 
 
 
536 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4209  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.27 
 
 
219 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3885  L-serine dehydratase subunit beta  43.27 
 
 
219 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3893  L-serine dehydratase, beta subunit  43.27 
 
 
219 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4162  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.27 
 
 
219 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4272  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.27 
 
 
220 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4248  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.27 
 
 
220 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4047  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  42.79 
 
 
219 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4361  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  42.79 
 
 
219 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2064  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.74 
 
 
224 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293764  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0199  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.86 
 
 
216 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000476395  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1475  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.67 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1252  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.9 
 
 
221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.809325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1075  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.67 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1965  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  37.32 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2145  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.54 
 
 
222 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0336  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.33 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.866527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0266  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.65 
 
 
224 aa  141  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1282  L-serine dehydratase beta subunit  40.28 
 
 
223 aa  138  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.38968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1947  L-serine ammonia-lyase  38.61 
 
 
218 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.376252  hitchhiker  0.000000222078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2853  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.67 
 
 
221 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0221158 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0887  L-serine ammonia-lyase  41.67 
 
 
223 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0556305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3836  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.5 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0141316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1074  L-serine ammonia-lyase  36.76 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000107918  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2095  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  39.17 
 
 
227 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2607  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.35 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2555  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.35 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2482  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.67 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3068  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  40 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.65769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3308  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  40 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3288  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5571  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40 
 
 
232 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.244703 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1548  serine dehydratase alpha chain  30.68 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000153411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  32.88 
 
 
459 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  30.43 
 
 
459 aa  58.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  31.03 
 
 
462 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  30.11 
 
 
462 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  30.11 
 
 
462 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  31.07 
 
 
462 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  29.55 
 
 
462 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33270  L-serine ammonia-lyase  29.88 
 
 
506 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  36.67 
 
 
456 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3319  L-serine ammonia-lyase  27.96 
 
 
557 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1196  L-serine ammonia-lyase  29.93 
 
 
477 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.741628  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10069  L-serine dehydratase sdaA  34.57 
 
 
461 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2740  serine dehydratase alpha chain  44.16 
 
 
460 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000127179  hitchhiker  0.000000403127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  29.95 
 
 
475 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  29.55 
 
 
462 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  29.55 
 
 
462 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6242  L-serine dehydratase 1  33.78 
 
 
482 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  41.98 
 
 
463 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  33.33 
 
 
455 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0288  L-serine ammonia-lyase  33.33 
 
 
455 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1195  L-serine dehydratase 1  30.61 
 
 
477 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4045  L-serine dehydratase 1  46.58 
 
 
471 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0118244  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0213  L-serine dehydratase 1  32.19 
 
 
462 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2194  L-serine dehydratase 1  32.64 
 
 
452 aa  51.6  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  32 
 
 
458 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2251  serine dehydratase alpha chain  27.85 
 
 
454 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.472865  normal  0.778553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  27.18 
 
 
458 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  27.93 
 
 
489 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  39.73 
 
 
458 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  48.48 
 
 
457 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  40.51 
 
 
475 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5008  L-serine dehydratase  38.1 
 
 
470 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.941789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1886  L-serine dehydratase 1  31.51 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  31.51 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0131  L-serine ammonia-lyase  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  28.77 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2483  L-serine dehydratase 1  30 
 
 
450 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1473  L-serine ammonia-lyase  38.64 
 
 
461 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0162786  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  42.31 
 
 
463 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4002  L-serine ammonia-lyase  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8589  L-serine dehydratase 1  41.46 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  45.21 
 
 
470 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1846  L-serine dehydratase 1  32.61 
 
 
458 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.393227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  39.73 
 
 
485 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1268  L-serine dehydratase 1  35 
 
 
459 aa  48.9  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>