215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1624 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  29.73 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  31.93 
 
 
403 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  31.93 
 
 
403 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  29.07 
 
 
468 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  27.45 
 
 
1036 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  29.08 
 
 
441 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.05 
 
 
343 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  31.58 
 
 
784 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  27.27 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  26.69 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  24.25 
 
 
932 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  25.7 
 
 
694 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  29.08 
 
 
946 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  25.41 
 
 
919 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  28.87 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  29.83 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  25.21 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  25.43 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  26.36 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  29.65 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  27.95 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  34.31 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  46.3 
 
 
225 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  22.44 
 
 
1362 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  28.93 
 
 
673 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  44.07 
 
 
413 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  43.86 
 
 
1821 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  36.49 
 
 
506 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  41.54 
 
 
536 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  31.09 
 
 
539 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  44.07 
 
 
502 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  44.44 
 
 
492 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  28.69 
 
 
542 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  30.25 
 
 
561 aa  55.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  44.07 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  30.25 
 
 
574 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  30.25 
 
 
531 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  40.68 
 
 
492 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  37.1 
 
 
548 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  42.37 
 
 
492 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  61.76 
 
 
1018 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  44.07 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  40.68 
 
 
510 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  40.68 
 
 
510 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  40.68 
 
 
510 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  31.62 
 
 
572 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  44 
 
 
767 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  32.45 
 
 
528 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  29.91 
 
 
563 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  27.73 
 
 
533 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  40.74 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  40.74 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  38.36 
 
 
461 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  38.36 
 
 
189 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  39.51 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  27.35 
 
 
606 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  30.77 
 
 
531 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  30.77 
 
 
518 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  45.1 
 
 
685 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  22.98 
 
 
252 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  22.98 
 
 
252 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  38.36 
 
 
461 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  29.77 
 
 
571 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  26.5 
 
 
578 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  34.85 
 
 
414 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  36.62 
 
 
1208 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  28.81 
 
 
550 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  29.41 
 
 
530 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  20.28 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  20.28 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  30.77 
 
 
581 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  30.77 
 
 
581 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  29.91 
 
 
529 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  37.5 
 
 
461 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  28.21 
 
 
629 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  35.37 
 
 
748 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  37.5 
 
 
461 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  29.91 
 
 
639 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  28.97 
 
 
641 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  28.21 
 
 
643 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  37.5 
 
 
461 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
491 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.98 
 
 
477 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  46.81 
 
 
575 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  45.24 
 
 
863 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  28.97 
 
 
593 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  40.91 
 
 
693 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  28.97 
 
 
591 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  28.21 
 
 
622 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1962  putative S-layer protein  36.23 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000041962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  29.06 
 
 
624 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  32.08 
 
 
544 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  38.89 
 
 
657 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  38.81 
 
 
1710 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  29.91 
 
 
543 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  30.77 
 
 
548 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  28.21 
 
 
658 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  38.18 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  40.32 
 
 
573 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>