More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1602 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
315 aa  605  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  51.51 
 
 
363 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  43.65 
 
 
350 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  42.17 
 
 
324 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 
312 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  44.05 
 
 
324 aa  225  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
324 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  44.76 
 
 
324 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  41.27 
 
 
317 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  44.59 
 
 
336 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 
330 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.78 
 
 
330 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
330 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  43.9 
 
 
322 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  39.63 
 
 
331 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  44.63 
 
 
310 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.13 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  44.59 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  41.67 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  43.17 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  40.71 
 
 
327 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  42.28 
 
 
318 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  41.4 
 
 
327 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42 
 
 
310 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  41.2 
 
 
318 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.67 
 
 
310 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
345 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
345 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  40.66 
 
 
345 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 
317 aa  208  9e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 
317 aa  208  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.26 
 
 
311 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  40.67 
 
 
337 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.54 
 
 
334 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  43.77 
 
 
337 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  43.77 
 
 
337 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
337 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
337 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  41.14 
 
 
345 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  43.21 
 
 
323 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
337 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  43.43 
 
 
335 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  43.05 
 
 
337 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.95 
 
 
835 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.66 
 
 
345 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
315 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
355 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  41.38 
 
 
306 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.64 
 
 
342 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  44.26 
 
 
326 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 
311 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.71 
 
 
311 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 
349 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.71 
 
 
311 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.71 
 
 
311 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 
311 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.46 
 
 
327 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 
311 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.91 
 
 
311 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  43 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.55 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.65 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  41.35 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  43 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  38.28 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  40.86 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.55 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.55 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  42.21 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  43.23 
 
 
328 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  40.96 
 
 
347 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.68 
 
 
311 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  41.36 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  39.53 
 
 
323 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  41.53 
 
 
355 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  36.72 
 
 
354 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  42.24 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  42.24 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.57 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  42.24 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  42.24 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  42.24 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  42.24 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  42.24 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  42.21 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  38.94 
 
 
333 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  38.99 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  40.59 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
346 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
343 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
333 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  41.44 
 
 
334 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  41.44 
 
 
342 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 
342 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
326 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
329 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
343 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  39.4 
 
 
322 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>