More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1570 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 474 aa  972    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  32.88 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.57 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 398 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  35.75 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 347 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 395 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.57 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.48 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 325 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  38.03 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 358 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.43 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 358 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.03 
 
 		 399 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26.76 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.16 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  37.79 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.29 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  32.86 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 501 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.81 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 395 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  32.46 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 368 aa  99.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 393 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 366 aa  99.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  22.76 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.56 
 
 		 390 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  30.05 
 
 		 358 aa  97.8  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 405 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 491 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 327 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 407 aa  96.7  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 393 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 319 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 382 aa  96.7  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 391 aa  96.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.9 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.39 
 
 		 355 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.67 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  21.95 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 367 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 565 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>