More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1561 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 455 aa  934    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 394 aa  143  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.67 
 
 		 483 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.31 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 477 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  24.14 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  23.28 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  22.17 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 281 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 450 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 449 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.1 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  21.34 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  25.38 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  21.16 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.74 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.36 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.9 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  22.43 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.29 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.97 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.71 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.71 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.71 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.71 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  22.66 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  22.83 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  31.65 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  31.88 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  23.32 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>