More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1554 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  483  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
248 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  35.04 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 
260 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 
243 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
255 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 
247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
231 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
244 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 
252 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 
249 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 
240 aa  119  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 
195 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 
195 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 
246 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.13 
 
 
233 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2332  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  30.9 
 
 
239 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  30.9 
 
 
239 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 
269 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
254 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
257 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
257 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  30.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  30.73 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  30.93 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  30.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  30.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  30.9 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  30.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  30.47 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  30.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
248 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  32.76 
 
 
250 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
230 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 
254 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 
254 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 
242 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 
245 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 
239 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 
185 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
243 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
256 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 
246 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
240 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.31 
 
 
232 aa  105  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 
241 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
264 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
265 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
256 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
265 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  28.09 
 
 
256 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
278 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  29.36 
 
 
239 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
256 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
256 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 
233 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.43 
 
 
242 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
241 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
241 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
252 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
252 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
252 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
266 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
248 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
246 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>