More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1516 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  62.61 
 
 
228 aa  296  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  54.26 
 
 
227 aa  268  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  54.26 
 
 
227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  56 
 
 
226 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  56.62 
 
 
225 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  55.3 
 
 
229 aa  248  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  54.79 
 
 
225 aa  248  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  49.77 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  49.07 
 
 
291 aa  241  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  236  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  50.23 
 
 
247 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  46.76 
 
 
258 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.73 
 
 
280 aa  233  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  45.95 
 
 
266 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  47.69 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.53 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  47.66 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  48 
 
 
269 aa  231  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.91 
 
 
245 aa  232  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  48.4 
 
 
258 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
264 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  46.73 
 
 
250 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  49.33 
 
 
226 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  46.73 
 
 
258 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  47.66 
 
 
256 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  48.34 
 
 
445 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
244 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  50 
 
 
257 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
279 aa  225  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.41 
 
 
255 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  47.75 
 
 
279 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  46.73 
 
 
255 aa  225  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.33 
 
 
274 aa  225  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  46.98 
 
 
455 aa  224  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  52.04 
 
 
249 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  45 
 
 
288 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  45.91 
 
 
277 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.66 
 
 
233 aa  222  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  45.45 
 
 
253 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
230 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  45.83 
 
 
258 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  46.15 
 
 
223 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  45.21 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
319 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.33 
 
 
264 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.19 
 
 
232 aa  218  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.64 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
246 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  47 
 
 
257 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  47.25 
 
 
293 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.29 
 
 
249 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
245 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  46.4 
 
 
239 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  46.05 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.19 
 
 
239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  47.11 
 
 
243 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
228 aa  215  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
233 aa  214  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  43.18 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  48.89 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.07 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  45.98 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  46.26 
 
 
240 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  46.19 
 
 
235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
271 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
227 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
261 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.54 
 
 
232 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 
232 aa  210  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  45.74 
 
 
252 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.26 
 
 
231 aa  210  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  45.66 
 
 
244 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  43.81 
 
 
243 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  45.83 
 
 
258 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
266 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 
222 aa  210  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  49.52 
 
 
229 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  49.04 
 
 
229 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.34 
 
 
233 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
221 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
236 aa  209  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  45.18 
 
 
248 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
246 aa  208  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 
248 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
248 aa  208  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  49.77 
 
 
234 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
234 aa  208  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  49.34 
 
 
235 aa  208  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  48.15 
 
 
243 aa  208  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>