126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1513 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  100 
 
 
270 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  92.96 
 
 
270 aa  445  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  47.41 
 
 
308 aa  265  8e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  42.96 
 
 
270 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  42.96 
 
 
270 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 
267 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  30.47 
 
 
365 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  31.2 
 
 
365 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 
365 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1930  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 
363 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  31.79 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 
380 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
370 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 
375 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1602  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.863835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 
368 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 
278 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 
269 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  22.94 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  29.66 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  28 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.61 
 
 
370 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  27.91 
 
 
383 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 
378 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 
366 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  29.66 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
370 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.84 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  28.83 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1474  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  21.76 
 
 
368 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
378 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  21.76 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  21.76 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  23.45 
 
 
953 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  23.45 
 
 
953 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  23.45 
 
 
941 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  51.11 
 
 
347 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  23.45 
 
 
953 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  23.45 
 
 
991 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.57 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
369 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 
261 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  23.74 
 
 
280 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  23.45 
 
 
941 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  23.45 
 
 
941 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 
981 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  23.45 
 
 
981 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 
369 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  25.82 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.55 
 
 
255 aa  45.4  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  42.65 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.24 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>