More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1444 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  100 
 
 
655 aa  1306  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.21 
 
 
646 aa  698  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.85 
 
 
650 aa  701  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  78.14 
 
 
399 aa  628  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  77.89 
 
 
399 aa  627  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  76 
 
 
402 aa  607  1e-172  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.98 
 
 
654 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  72.11 
 
 
400 aa  587  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.1291e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.85 
 
 
687 aa  570  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  64.68 
 
 
399 aa  505  1e-142  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  58.69 
 
 
394 aa  466  1e-130  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  58.69 
 
 
394 aa  465  1e-130  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.43166e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 
394 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 
394 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.25846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 
394 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  8.97427e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 
394 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  58.44 
 
 
394 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  57.79 
 
 
397 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 
394 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  59.14 
 
 
396 aa  461  1e-128  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  57.68 
 
 
394 aa  460  1e-128  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.83752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  61.19 
 
 
398 aa  462  1e-128  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 
392 aa  460  1e-128  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  57.68 
 
 
394 aa  458  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  57.93 
 
 
394 aa  459  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  57.93 
 
 
394 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  57.68 
 
 
394 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  56.62 
 
 
405 aa  454  1e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  55.36 
 
 
402 aa  450  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  55.2 
 
 
402 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  58.82 
 
 
407 aa  451  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  56.72 
 
 
404 aa  449  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  57.32 
 
 
393 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  57.18 
 
 
393 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  55.92 
 
 
393 aa  448  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  56.93 
 
 
396 aa  448  1e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.5474e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  56.61 
 
 
401 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  55.53 
 
 
397 aa  444  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  54.41 
 
 
392 aa  440  1e-122  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  57.04 
 
 
397 aa  441  1e-122  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  57.07 
 
 
403 aa  441  1e-122  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  57.29 
 
 
397 aa  442  1e-122  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  53.63 
 
 
400 aa  439  1e-122  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  57.21 
 
 
396 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  56.06 
 
 
395 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.08196e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  56.86 
 
 
403 aa  436  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 
400 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  57.21 
 
 
396 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 
400 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  55.16 
 
 
393 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl577  phosphoglycerate kinase  55.8 
 
 
404 aa  429  1e-119  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  55.95 
 
 
394 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  56.27 
 
 
406 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  55.72 
 
 
399 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.37872e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0248  phosphoglycerate kinase  57.67 
 
 
398 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  53.83 
 
 
403 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  56.31 
 
 
395 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 
401 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  53.47 
 
 
402 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  56.47 
 
 
396 aa  429  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  53.27 
 
 
397 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  55.8 
 
 
404 aa  429  1e-118  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  56.85 
 
 
400 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1755  phosphoglycerate kinase  57.99 
 
 
399 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.542191  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  54.52 
 
 
401 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  55.04 
 
 
401 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1766  phosphoglycerate kinase  57.43 
 
 
398 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  52.28 
 
 
443 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  52.5 
 
 
396 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  55.78 
 
 
398 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  54.5 
 
 
401 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  53.52 
 
 
395 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  54.8 
 
 
395 aa  416  1e-115  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  53.27 
 
 
395 aa  419  1e-115  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  53.98 
 
 
401 aa  418  1e-115  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  54.71 
 
 
396 aa  417  1e-115  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  53.65 
 
 
397 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  52.74 
 
 
402 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  52.74 
 
 
402 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  52.39 
 
 
394 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  52.38 
 
 
395 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  52.74 
 
 
402 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  52.24 
 
 
402 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  51.5 
 
 
397 aa  407  1e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  53.27 
 
 
394 aa  408  1e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  53.73 
 
 
435 aa  407  1e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  54.31 
 
 
441 aa  407  1e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  54.8 
 
 
398 aa  408  1e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  52.26 
 
 
397 aa  408  1e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  56.09 
 
 
400 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 
399 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  52.01 
 
 
397 aa  405  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  53.55 
 
 
396 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
398 aa  401  1e-110  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  52.78 
 
 
401 aa  401  1e-110  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 
389 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  52.25 
 
 
396 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
393 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  52.5 
 
 
396 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  51.89 
 
 
394 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>