More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1391 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  100 
 
 
141 aa  269  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  44.03 
 
 
151 aa  113  8e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  44.03 
 
 
148 aa  113  9e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  44.78 
 
 
148 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  42.22 
 
 
151 aa  100  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  35.56 
 
 
163 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  37.5 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.34 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.54 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  30.28 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  30.37 
 
 
152 aa  82.8  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  31.88 
 
 
146 aa  82.8  1e-15  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  30.22 
 
 
155 aa  81.6  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  32.12 
 
 
169 aa  81.6  4e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.37 
 
 
156 aa  80.9  5e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  31.16 
 
 
146 aa  80.9  5e-15  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.37 
 
 
156 aa  80.9  5e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  35.92 
 
 
528 aa  80.9  6e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.16 
 
 
146 aa  80.1  9e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  31.58 
 
 
171 aa  80.1  1e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.71 
 
 
154 aa  80.1  1e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  28.15 
 
 
155 aa  78.6  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  29.93 
 
 
152 aa  78.2  4e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  29.93 
 
 
152 aa  78.2  4e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  27.41 
 
 
155 aa  77  7e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  34.51 
 
 
154 aa  76.6  9e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  34.33 
 
 
139 aa  76.3  1e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  35.38 
 
 
159 aa  76.6  1e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  35 
 
 
478 aa  75.9  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  32.35 
 
 
150 aa  75.5  2e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.84 
 
 
170 aa  75.5  2e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  28.89 
 
 
161 aa  75.5  2e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  31.85 
 
 
145 aa  75.9  2e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  30.66 
 
 
154 aa  75.5  2e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.41 
 
 
189 aa  75.5  2e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  34.81 
 
 
136 aa  75.5  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.25581e-06 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  32.09 
 
 
331 aa  75.9  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.63 
 
 
164 aa  75.1  3e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  26.32 
 
 
157 aa  75.5  3e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  29.5 
 
 
155 aa  75.5  3e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  28.99 
 
 
518 aa  75.1  3e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.34 
 
 
159 aa  75.5  3e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.2 
 
 
187 aa  74.3  5e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  30.3 
 
 
155 aa  74.3  5e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.53 
 
 
162 aa  73.9  6e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  33.33 
 
 
170 aa  73.9  6e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  30.71 
 
 
253 aa  73.9  7e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  26.67 
 
 
158 aa  73.6  9e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  29.08 
 
 
159 aa  73.6  9e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  26.28 
 
 
154 aa  72.8  1e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30.22 
 
 
147 aa  73.2  1e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  29.93 
 
 
164 aa  73.2  1e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.45541e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  27.46 
 
 
150 aa  73.2  1e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  26.67 
 
 
158 aa  73.2  1e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  27.94 
 
 
155 aa  73.6  1e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  29.93 
 
 
165 aa  72  2e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  28.47 
 
 
165 aa  72.8  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  29.93 
 
 
165 aa  72  2e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46725e-13 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  31.82 
 
 
141 aa  72  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  32.09 
 
 
165 aa  72  2e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.33 
 
 
163 aa  72.4  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  28.68 
 
 
183 aa  71.6  3e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  28.06 
 
 
177 aa  71.6  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  28.37 
 
 
157 aa  71.6  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  32.59 
 
 
154 aa  71.6  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.85 
 
 
167 aa  71.6  4e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  27.34 
 
 
178 aa  71.6  4e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  30.3 
 
 
218 aa  71.2  4e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  31.62 
 
 
169 aa  71.6  4e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  27.34 
 
 
178 aa  71.2  4e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.43 
 
 
163 aa  71.2  5e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  28.06 
 
 
178 aa  70.9  6e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  31.25 
 
 
164 aa  70.9  6e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.06 
 
 
183 aa  70.5  7e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  26.15 
 
 
157 aa  70.5  8e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.56 
 
 
164 aa  69.7  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  29.41 
 
 
163 aa  70.1  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  30.15 
 
 
150 aa  69.3  1e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  29.29 
 
 
194 aa  69.7  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  31.43 
 
 
262 aa  70.1  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  30.94 
 
 
167 aa  69.7  1e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  33.56 
 
 
907 aa  70.1  1e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.65 
 
 
169 aa  69.7  1e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  38.3 
 
 
165 aa  69.7  1e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.41 
 
 
164 aa  68.9  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23984e-08 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  33.82 
 
 
140 aa  69.3  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  29.66 
 
 
159 aa  68.9  2e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  28.93 
 
 
169 aa  68.9  2e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  27.54 
 
 
176 aa  69.3  2e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  26.09 
 
 
174 aa  68.9  2e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 
153 aa  68.9  2e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.66 
 
 
165 aa  68.6  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4863e-14 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  25.93 
 
 
159 aa  68.6  3e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.66 
 
 
165 aa  68.6  3e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  26.06 
 
 
228 aa  68.2  3e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  29.37 
 
 
161 aa  68.2  3e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  30.88 
 
 
185 aa  68.2  3e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  30.43 
 
 
165 aa  68.2  4e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  30.4 
 
 
147 aa  67.8  4e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  30.4 
 
 
147 aa  67.8  4e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>