195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1340 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 467 aa  946    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 463 aa  113  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 489 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 476 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 465 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.59 
 
 		 450 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 473 aa  90.5  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  22.95 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  21.72 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 800 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 476 aa  67  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  21.29 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  20.47 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  21.12 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  19.65 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.23 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  21.88 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  21.28 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  22.13 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  20.29 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  23.28 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.57 
 
 		 365 aa  56.6  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  21.97 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 391 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  21.97 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  21.78 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1924  radical SAM superfamily protein  24.57 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  21.78 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  20.99 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 464 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 446 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 449 aa  53.5  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 270 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>