More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1224 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  53.15 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  53.15 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
297 aa  288  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 
304 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
292 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
298 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
297 aa  261  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
289 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
297 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 
295 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
293 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 
290 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
293 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
296 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 
294 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 
296 aa  255  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 
297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 
290 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  43.17 
 
 
290 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  43.96 
 
 
290 aa  248  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  43.59 
 
 
290 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 
296 aa  247  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 
291 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
292 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 
296 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
292 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  42.39 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  40.64 
 
 
292 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
297 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 
290 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 
292 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 
291 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 
293 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  39.24 
 
 
292 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
290 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 
291 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 
289 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 
291 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
296 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  38.54 
 
 
293 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 
293 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 
291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 
292 aa  235  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 
289 aa  235  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  38.03 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  38.31 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 
297 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 
292 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  38.19 
 
 
293 aa  232  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  41.09 
 
 
289 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 
293 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
290 aa  232  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
292 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 
296 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 
289 aa  231  9e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  37.85 
 
 
292 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 
292 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 
293 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 
292 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
292 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 
292 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  38.03 
 
 
293 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
292 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
292 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
292 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
292 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
290 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
297 aa  229  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 
292 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  39.01 
 
 
292 aa  228  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 
308 aa  228  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 
297 aa  228  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 
291 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 
298 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  41.33 
 
 
292 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 
291 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  39.02 
 
 
296 aa  226  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 
295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  40.86 
 
 
289 aa  226  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 
298 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 
293 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 
298 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 
292 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 
295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 
300 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 
297 aa  226  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  39.02 
 
 
290 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>