More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1217 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  100 
 
 
316 aa  642    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  54.58 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  54.58 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  51.44 
 
 
308 aa  301  9e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  49.68 
 
 
313 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  39.68 
 
 
320 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  38.64 
 
 
321 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  38.71 
 
 
315 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  35.9 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  35.85 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  37.34 
 
 
312 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.75 
 
 
321 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  35.9 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.31 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.88 
 
 
321 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.96 
 
 
347 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.01 
 
 
315 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.01 
 
 
315 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.19 
 
 
315 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  35.87 
 
 
321 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  37.01 
 
 
312 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  38.02 
 
 
321 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  34.63 
 
 
317 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  33.12 
 
 
317 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.44 
 
 
300 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  33.33 
 
 
318 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.8 
 
 
323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.05 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  36.04 
 
 
316 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.49 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  34.41 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.7 
 
 
342 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.14 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  37.5 
 
 
317 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.63 
 
 
316 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.66 
 
 
312 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.81 
 
 
328 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  34.84 
 
 
323 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  34.52 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.92 
 
 
299 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.69 
 
 
306 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.55 
 
 
327 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  34.84 
 
 
327 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0466  ROK family protein  35.74 
 
 
313 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33.01 
 
 
302 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.77 
 
 
335 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  31.69 
 
 
404 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  32.61 
 
 
332 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  31.55 
 
 
306 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  32.91 
 
 
316 aa  151  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.34 
 
 
389 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.84 
 
 
300 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  34.41 
 
 
316 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  34.49 
 
 
315 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  31.52 
 
 
336 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.82 
 
 
314 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  34.89 
 
 
332 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  34.89 
 
 
340 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  32.59 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  36.1 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.01 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.45 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  33.85 
 
 
328 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  31.73 
 
 
318 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  30.75 
 
 
332 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  33.01 
 
 
314 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  30.94 
 
 
313 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.42 
 
 
319 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 
317 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.94 
 
 
408 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  34.92 
 
 
396 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  32.48 
 
 
313 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  33.66 
 
 
363 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  31.49 
 
 
336 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0225  glucokinase, putative  32.41 
 
 
329 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  32.05 
 
 
312 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.57 
 
 
410 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  33.44 
 
 
319 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.55 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  34.08 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  33.02 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.53 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  31.03 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  29.62 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  30.97 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  26.52 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  30.13 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  30.16 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.97 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  31.01 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  30.97 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  32.47 
 
 
363 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>