More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1199 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 495 aa  985    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0587  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0572  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  27.79 
 
 		 591 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  27.15 
 
 		 540 aa  193  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  27.13 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  27.63 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  28.14 
 
 		 593 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1634  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  29.01 
 
 		 521 aa  187  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.412877  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  27.88 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 367 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  26.87 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  28.08 
 
 		 579 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  30.64 
 
 		 362 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  30.11 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  26.24 
 
 		 560 aa  173  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  28.22 
 
 		 539 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  32.87 
 
 		 343 aa  173  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  34.68 
 
 		 358 aa  173  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  27.88 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  27.88 
 
 		 604 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  35.6 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  35.99 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  32.17 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  26.01 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  33.66 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  34.95 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  35.77 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  33.66 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  30.39 
 
 		 355 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  30.87 
 
 		 358 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  32.29 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  31.07 
 
 		 361 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  32.97 
 
 		 366 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  35.17 
 
 		 372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  29.39 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  31.94 
 
 		 370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  32.8 
 
 		 359 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  33.97 
 
 		 372 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  32.35 
 
 		 369 aa  163  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  34.48 
 
 		 366 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  30.94 
 
 		 362 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  31.38 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  31.21 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  37.27 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  31.13 
 
 		 358 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  31.13 
 
 		 358 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  32.68 
 
 		 368 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  31.13 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  33.91 
 
 		 364 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  32.68 
 
 		 368 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  32.79 
 
 		 359 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  31.21 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  30.32 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  32.17 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  32.1 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  32.57 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.77 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  30.79 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  30.64 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  32.79 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  32.85 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  30.82 
 
 		 359 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  32.86 
 
 		 359 aa  158  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  33.87 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  33.99 
 
 		 355 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  32.28 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  33.12 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  30.46 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  31.77 
 
 		 366 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  31.27 
 
 		 364 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  31.27 
 
 		 364 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  31.73 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  31.73 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  31.73 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  31.73 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  31.21 
 
 		 376 aa  157  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  30.3 
 
 		 359 aa  156  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  31.02 
 
 		 359 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  30.55 
 
 		 368 aa  156  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  30.07 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  30.22 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  33.87 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1553  3-dehydroquinate synthase  34.18 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.559547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1524  3-dehydroquinate synthase  34.18 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  33.45 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>