More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1198 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  64.75 
 
 
144 aa  200  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  64.75 
 
 
144 aa  200  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.16 
 
 
145 aa  167  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  156  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 
142 aa  154  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.29 
 
 
160 aa  148  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
146 aa  147  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
148 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
144 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
145 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
146 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 
159 aa  143  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.37 
 
 
145 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  48.09 
 
 
147 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
149 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 
142 aa  141  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
151 aa  141  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.25 
 
 
147 aa  140  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 
161 aa  140  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
207 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3059  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00663855  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 
207 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
207 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 
150 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  50.38 
 
 
146 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 
152 aa  135  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  48.23 
 
 
153 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 
160 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 
156 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 
155 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 
150 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
150 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 
150 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.08 
 
 
144 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.32 
 
 
142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  48.12 
 
 
159 aa  134  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 
150 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
149 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
152 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
152 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
156 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  47.37 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  47.37 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.48 
 
 
184 aa  133  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 
157 aa  133  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.72 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  42.45 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.15 
 
 
165 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.59 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  44.06 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  44.36 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  46.62 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
152 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 
146 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 
145 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.22 
 
 
145 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
141 aa  130  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
161 aa  130  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 
147 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
154 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
158 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
147 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>