65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1174 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  100 
 
 		 379 aa  733    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1549  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0816  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.02 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  19.95 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  24.71 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  22.14 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  22.47 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  24.86 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  22.31 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.92 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.94 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  22.67 
 
 		 433 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 390 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  21.96 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  21.96 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  21.96 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.51 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  21.55 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.3 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  22.46 
 
 		 440 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  21.09 
 
 		 394 aa  46.2  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 425 aa  46.2  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  21.47 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  22.36 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.3 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  19.44 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  22.36 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  19.17 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  18.44 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  22.05 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  23.15 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  24.75 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  22.59 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  22.67 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  20.63 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  22.67 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  22.05 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 401 aa  42.7  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  22.44 
 
 		 397 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>