205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1124 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  214  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  34.92 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  40.32 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  36.17 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 465 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  43.64 
 
 		 227 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  37.5 
 
 		 342 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  35.38 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 		 376 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 491 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  42.22 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  35.71 
 
 		 215 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 300 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2648  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.552058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 220 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 266 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 374 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0045  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000742068  hitchhiker  0.0000000000614145 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>