More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1064 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 328 aa  678    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  59.56 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  59.56 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  57.68 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  55.97 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  58.62 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  54.89 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  52.63 
 
 		 331 aa  359  3e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 332 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  54.83 
 
 		 330 aa  358  8e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 328 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  53.07 
 
 		 333 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.44 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 328 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 337 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  52.68 
 
 		 328 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  52.48 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  54.09 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  52.16 
 
 		 326 aa  345  7e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  50.77 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  49.54 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 330 aa  338  5e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 330 aa  338  5e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  48.62 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 332 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  50.15 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 332 aa  332  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 332 aa  331  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  51.56 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 330 aa  328  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  48.44 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 320 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 327 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 329 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  48.77 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  47.87 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  47.87 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 325 aa  312  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 		 334 aa  311  6.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  49.21 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  45.77 
 
 		 327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  47.83 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 320 aa  301  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 328 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  48.6 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  45.28 
 
 		 328 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  46.42 
 
 		 329 aa  298  8e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.15 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  45.91 
 
 		 329 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 328 aa  295  8e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  44.3 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  43.67 
 
 		 330 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  44.89 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  43.67 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.48 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 323 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  45.12 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  43.77 
 
 		 373 aa  288  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  43.52 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  47.47 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  43.99 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  45.66 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  48.25 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>