More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0989 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 295 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  32 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 		 368 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  29.73 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  30.22 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  30.16 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  29.69 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.3 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.14 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.48 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0801  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0824  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.24 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.62 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  28.09 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.6 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.66 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  28.46 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.3 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.18 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  30.53 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  30.53 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  28.68 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  28.98 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.68 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.86 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  28.27 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  28.27 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  30.74 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.68 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28.68 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 		 344 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 347 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.07 
 
 		 514 aa  106  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.85 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.85 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.29 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.9 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.89 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  26.52 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.44 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  26 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.65 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.24 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.24 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.31 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  28.35 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.31 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  25.09 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.28 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  28.76 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.44 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.44 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.44 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.44 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  29.39 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.52 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  28.35 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.38 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.93 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  30.03 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  26.04 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  24.8 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>