297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0958 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  100 
 
 
204 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  84.31 
 
 
204 aa  363  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  59.5 
 
 
204 aa  248  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  58.42 
 
 
203 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  58.5 
 
 
203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  58.42 
 
 
203 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  56.25 
 
 
208 aa  234  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  57.43 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  56.44 
 
 
204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  55.94 
 
 
200 aa  230  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  57.43 
 
 
200 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  56.44 
 
 
200 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  56.93 
 
 
200 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  56.37 
 
 
200 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  55.45 
 
 
200 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  56.44 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  56.93 
 
 
200 aa  227  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  54.41 
 
 
199 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  56.93 
 
 
200 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  56.86 
 
 
199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  53.43 
 
 
199 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  53.43 
 
 
199 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  55.88 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  53 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  54.73 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  51.96 
 
 
199 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
200 aa  218  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
200 aa  218  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  53.47 
 
 
200 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  50.49 
 
 
201 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  57.5 
 
 
212 aa  215  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  54.41 
 
 
199 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  54.9 
 
 
199 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  52.02 
 
 
206 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  52.97 
 
 
199 aa  205  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  53 
 
 
204 aa  204  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  53.92 
 
 
198 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  53.92 
 
 
198 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  53.92 
 
 
198 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  53.92 
 
 
198 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  53.92 
 
 
198 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  51.96 
 
 
199 aa  203  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  51.49 
 
 
200 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  50 
 
 
207 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  53.47 
 
 
198 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  51.47 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  54.9 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
198 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  52.45 
 
 
198 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
198 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
198 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  52.45 
 
 
198 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
198 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
198 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  51.94 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  50.73 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  52.45 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  52.94 
 
 
198 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  51.96 
 
 
198 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  49.27 
 
 
200 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  50.98 
 
 
199 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  52.97 
 
 
198 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  50.98 
 
 
199 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  49.76 
 
 
199 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  50 
 
 
199 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.02 
 
 
202 aa  187  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  49.02 
 
 
199 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  49.51 
 
 
199 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  52.24 
 
 
203 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  47.06 
 
 
199 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  52.48 
 
 
198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  49.02 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  48.53 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  48.78 
 
 
199 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  48.54 
 
 
199 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  48.51 
 
 
199 aa  178  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  48.98 
 
 
203 aa  177  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  48.02 
 
 
199 aa  177  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  48.06 
 
 
199 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  49.76 
 
 
199 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  47.8 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  43.56 
 
 
218 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8249  flavoprotein WrbA  45.59 
 
 
199 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.85 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  41.09 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  47.6 
 
 
199 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  41.09 
 
 
199 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  43.28 
 
 
209 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  41.09 
 
 
199 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  45.77 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.6 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.79 
 
 
205 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  45.05 
 
 
208 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  40.2 
 
 
206 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31495  predicted protein  39.47 
 
 
201 aa  147  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0157173  normal  0.0627326 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.46 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85539  predicted protein  40.59 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  39.05 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>