More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0939 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
348 aa  709    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  76.7 
 
 
352 aa  558  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  78.11 
 
 
339 aa  541  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.38 
 
 
351 aa  495  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.38 
 
 
354 aa  494  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.84 
 
 
349 aa  441  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.84 
 
 
349 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.38 
 
 
356 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.86 
 
 
355 aa  425  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.44 
 
 
362 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.59 
 
 
352 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.69 
 
 
342 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.79 
 
 
362 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 
358 aa  411  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.89 
 
 
337 aa  411  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.61 
 
 
355 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.83 
 
 
330 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.4 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2401  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.45 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 
357 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.66 
 
 
329 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.56 
 
 
359 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.28 
 
 
350 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  59.14 
 
 
360 aa  391  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0602  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.32 
 
 
379 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159192  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.6 
 
 
336 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.49 
 
 
318 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.32 
 
 
379 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.71 
 
 
344 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.97 
 
 
354 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.04 
 
 
354 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.75 
 
 
322 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.97 
 
 
323 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.78 
 
 
354 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 
350 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.27 
 
 
355 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.45 
 
 
336 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.24 
 
 
361 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.97 
 
 
323 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 
322 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.75 
 
 
322 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.45 
 
 
322 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.99 
 
 
349 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.75 
 
 
322 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 
342 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.87 
 
 
336 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.45 
 
 
322 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.39 
 
 
360 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.72 
 
 
355 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 
336 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.05 
 
 
322 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  52.81 
 
 
352 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  52.81 
 
 
352 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.14 
 
 
357 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.3 
 
 
355 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.37 
 
 
362 aa  378  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.97 
 
 
351 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.37 
 
 
356 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.59 
 
 
349 aa  378  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.7 
 
 
349 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 
341 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.7 
 
 
353 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.19 
 
 
341 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.89 
 
 
348 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
357 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.34 
 
 
345 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.23 
 
 
366 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.12 
 
 
338 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 
351 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.27 
 
 
353 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.27 
 
 
353 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 
359 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
355 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.38 
 
 
354 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.27 
 
 
354 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.15 
 
 
340 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.56 
 
 
356 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.7 
 
 
355 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.16 
 
 
340 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
353 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 
341 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.96 
 
 
366 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.42 
 
 
353 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
353 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
360 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.21 
 
 
354 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
350 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.87 
 
 
351 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.14 
 
 
355 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.34 
 
 
351 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
400 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.24 
 
 
353 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
400 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.81 
 
 
366 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
350 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
352 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.87 
 
 
355 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.92 
 
 
351 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>