23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0934 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  323  7e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  94.48 
 
 
170 aa  293  8e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  46.25 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  46.25 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1706  hypothetical protein  29.85 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0763417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  28.33 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  31.4 
 
 
204 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  29.51 
 
 
212 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
106 aa  55.1  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  29.89 
 
 
134 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  36.49 
 
 
119 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 
123 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 
105 aa  50.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  40.62 
 
 
208 aa  47.4  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
119 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
124 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 
125 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  26.37 
 
 
205 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>