More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0924 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  47.33 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.39 
 
 
309 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  42.16 
 
 
304 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.47 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.93 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.18 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  34.65 
 
 
316 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.46 
 
 
307 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  36.42 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.25 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.87 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  38.24 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  36.72 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  36.72 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  34.32 
 
 
306 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  35.74 
 
 
303 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.21 
 
 
305 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  33.44 
 
 
308 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  34.1 
 
 
315 aa  168  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  33.77 
 
 
308 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  35.41 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  35.41 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  38.38 
 
 
297 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  39.02 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  33.66 
 
 
303 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.07 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  36.57 
 
 
306 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  34.08 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  36.21 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  33.02 
 
 
313 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  36.54 
 
 
308 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  35.2 
 
 
306 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  36.54 
 
 
308 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  36.54 
 
 
308 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  33.55 
 
 
305 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  36.04 
 
 
308 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  33.55 
 
 
298 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  35.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  37.09 
 
 
303 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  32.45 
 
 
321 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  32.45 
 
 
309 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  32.45 
 
 
311 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  34.94 
 
 
306 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  32.45 
 
 
311 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  36.54 
 
 
306 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32.12 
 
 
308 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  35.97 
 
 
307 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  32.45 
 
 
311 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  33.55 
 
 
302 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  33.11 
 
 
295 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  35.88 
 
 
318 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  36.54 
 
 
295 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  31.79 
 
 
308 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  33.22 
 
 
307 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.46 
 
 
312 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  33.66 
 
 
301 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  33.77 
 
 
304 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  32.67 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  36.12 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  36.12 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  34.65 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  36.12 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  33.22 
 
 
302 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  35.12 
 
 
309 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  32.12 
 
 
321 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  33.01 
 
 
307 aa  152  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  34.88 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  36.54 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.79 
 
 
310 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  34.88 
 
 
310 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  35.79 
 
 
309 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  34.77 
 
 
298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  33.55 
 
 
308 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  36.63 
 
 
303 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  34.22 
 
 
302 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  33.55 
 
 
308 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  33.55 
 
 
308 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  33.33 
 
 
307 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  36.21 
 
 
305 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  33.11 
 
 
314 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  33.77 
 
 
298 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  33 
 
 
315 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  33.97 
 
 
305 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33.77 
 
 
340 aa  149  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  34.44 
 
 
298 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  35.1 
 
 
304 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  34.22 
 
 
309 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  33.77 
 
 
298 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  33.77 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.68 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  32.67 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  33.77 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  33.77 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  34.11 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  34.11 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  33.12 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  33.66 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  33.66 
 
 
303 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  33.66 
 
 
303 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>