42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0912 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  44.25 
 
 		 283 aa  244  8e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  42.51 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  42.09 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  34.98 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  27.99 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 355 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 371 aa  92.8  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  18.04 
 
 		 371 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  20.94 
 
 		 359 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  24.78 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  22.16 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  23.12 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  20.3 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  20.2 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  27.13 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  22.52 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  24.39 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  24.17 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  17.93 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  21.54 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  23.43 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 367 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>