More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0885 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  100 
 
 
612 aa  1263    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  61.05 
 
 
616 aa  772    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  59.22 
 
 
615 aa  790    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  57.12 
 
 
615 aa  709    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  44.61 
 
 
598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.24 
 
 
1487 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.24 
 
 
891 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.02 
 
 
466 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  37.29 
 
 
470 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.7 
 
 
895 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.9 
 
 
914 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  37.28 
 
 
468 aa  253  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  37.09 
 
 
468 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  36.46 
 
 
469 aa  249  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.76 
 
 
458 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  34.33 
 
 
469 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  35.92 
 
 
468 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  35.92 
 
 
468 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  34.12 
 
 
469 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  35.97 
 
 
455 aa  244  5e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.15 
 
 
555 aa  244  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.15 
 
 
1481 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.12 
 
 
457 aa  241  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.78 
 
 
653 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.31 
 
 
464 aa  240  5.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.51 
 
 
653 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  34.82 
 
 
463 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.51 
 
 
653 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  35.81 
 
 
469 aa  238  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.51 
 
 
653 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.33 
 
 
467 aa  237  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.84 
 
 
652 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.48 
 
 
614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.48 
 
 
653 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.42 
 
 
476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.35 
 
 
653 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.21 
 
 
667 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 
438 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.91 
 
 
464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.76 
 
 
463 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  33.57 
 
 
1150 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
470 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.53 
 
 
663 aa  231  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.91 
 
 
464 aa  231  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.54 
 
 
612 aa  230  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.32 
 
 
476 aa  230  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.91 
 
 
465 aa  230  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
471 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  37.02 
 
 
747 aa  227  6e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.72 
 
 
659 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.77 
 
 
648 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.4 
 
 
674 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.56 
 
 
1126 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.22 
 
 
674 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2118  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 
615 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  35.07 
 
 
493 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.62 
 
 
761 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.55 
 
 
659 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.55 
 
 
469 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  33.9 
 
 
468 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  29.55 
 
 
659 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.55 
 
 
659 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  29.55 
 
 
659 aa  223  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  29.55 
 
 
659 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.55 
 
 
659 aa  223  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.71 
 
 
461 aa  223  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.02 
 
 
671 aa  223  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.42 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.56 
 
 
646 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.55 
 
 
659 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1552  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.29 
 
 
646 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.39 
 
 
699 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  32.84 
 
 
465 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.42 
 
 
465 aa  219  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.59 
 
 
658 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.54 
 
 
658 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.44 
 
 
474 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  34.54 
 
 
707 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.55 
 
 
480 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  34.26 
 
 
462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  33.86 
 
 
412 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.86 
 
 
412 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  33.86 
 
 
412 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  33.86 
 
 
412 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  33.7 
 
 
469 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  33.41 
 
 
459 aa  217  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  27.88 
 
 
652 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  27.71 
 
 
671 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  31.63 
 
 
465 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.38 
 
 
996 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  33.48 
 
 
465 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  33.86 
 
 
412 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  27.42 
 
 
671 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  33.64 
 
 
412 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  32.57 
 
 
482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2293  putative oxidoreductase  33.64 
 
 
412 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.41 
 
 
447 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  32.55 
 
 
477 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2441  putative oxidoreductase  33.86 
 
 
412 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.02 
 
 
463 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>