More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0875 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  71.97 
 
 		 239 aa  347  7e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  71.97 
 
 		 239 aa  347  7e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  67.78 
 
 		 239 aa  333  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  67.36 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.75 
 
 		 237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.5 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  48.68 
 
 		 226 aa  218  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.67 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.67 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.67 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.67 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.67 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.67 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.67 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.67 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.67 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.38 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  45.99 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  47.03 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 226 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.81 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.93 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  45.73 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  47.64 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  44.73 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  46.58 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  46.55 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  46.58 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.15 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  46.15 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  46.15 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  46.15 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  46.15 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.42 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  44.74 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  46.78 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 242 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 245 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 242 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.7 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  43.59 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>