More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0851 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  57.73 
 
 		 240 aa  255  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 225 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  54.75 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 224 aa  235  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  51.36 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 223 aa  234  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  50 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.27 
 
 		 227 aa  224  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  48.65 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  48.2 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  48.2 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.75 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 283 aa  218  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  47.27 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1233  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0842153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1012  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 222 aa  208  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  49.31 
 
 		 219 aa  207  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  47.09 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  47.51 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 224 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.21 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 228 aa  204  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.64 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5672  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  47.32 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  47.73 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  48.87 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  48.65 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 227 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  48.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  48.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  48.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  48.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 226 aa  201  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  48.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  48.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  48.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  45.25 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.32 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1742  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  48.18 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  47.75 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.25 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  47.98 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  45.7 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6111  regulator protein CopR  48.87 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>