More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0835 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
646 aa  637  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
638 aa  676  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
644 aa  637  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
640 aa  712  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
640 aa  1324  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
639 aa  706  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
639 aa  689  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 
635 aa  690  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.83369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
636 aa  648  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
637 aa  685  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
636 aa  667  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
639 aa  710  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
645 aa  677  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
644 aa  642  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
636 aa  664  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
636 aa  682  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.92835e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
640 aa  871  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
639 aa  705  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
633 aa  716  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 
634 aa  697  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 
635 aa  719  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
640 aa  711  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
639 aa  703  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
635 aa  685  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 
638 aa  855  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 
635 aa  752  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
636 aa  668  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
640 aa  690  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
640 aa  687  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
634 aa  704  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 
636 aa  869  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
645 aa  661  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
640 aa  708  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
637 aa  677  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
631 aa  652  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.76694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 
640 aa  868  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
639 aa  707  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
643 aa  643  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.77582e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
639 aa  706  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
638 aa  647  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
639 aa  703  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
635 aa  731  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
647 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
662 aa  625  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
644 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
644 aa  628  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
634 aa  623  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
642 aa  623  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
635 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
644 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
643 aa  619  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
644 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
645 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
645 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
644 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.86283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
643 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
645 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
643 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.753e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
645 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
645 aa  617  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
641 aa  617  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
649 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
645 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  46 
 
 
635 aa  612  1e-174  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
644 aa  613  1e-174  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  2.63348e-08  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
645 aa  614  1e-174  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
637 aa  613  1e-174  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67344e-05 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
645 aa  612  1e-174  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.71694e-05  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
645 aa  613  1e-174  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.66692e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
633 aa  613  1e-174  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
645 aa  614  1e-174  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
642 aa  610  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
646 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.88041e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
645 aa  609  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
635 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
635 aa  605  1e-172  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  46 
 
 
635 aa  605  1e-172  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
644 aa  605  1e-172  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  606  1e-172  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
638 aa  607  1e-172  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
642 aa  607  1e-172  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  607  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  607  1e-172  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
635 aa  605  1e-172  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  606  1e-172  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  607  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  46 
 
 
635 aa  606  1e-172  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  605  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2222  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
642 aa  602  1e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.82535e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
635 aa  603  1e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2263  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
642 aa  603  1e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.63048e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 
636 aa  602  1e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
635 aa  603  1e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2184  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
642 aa  602  1e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00110297  normal  0.0619303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2330  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
642 aa  602  1e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0271546  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
642 aa  604  1e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.63633e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>