100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0829 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  49.78 
 
 
669 aa  688    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  61.35 
 
 
686 aa  919    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  100 
 
 
687 aa  1430    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  61.35 
 
 
686 aa  919    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  61.93 
 
 
685 aa  919    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  62.76 
 
 
688 aa  929    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  61.14 
 
 
685 aa  899    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  60.91 
 
 
686 aa  904    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  61.48 
 
 
689 aa  939    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  61.05 
 
 
686 aa  901    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  61.92 
 
 
689 aa  940    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  43.13 
 
 
683 aa  613  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  43.73 
 
 
679 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  43.27 
 
 
683 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  40.09 
 
 
672 aa  521  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  38.68 
 
 
672 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  39.33 
 
 
672 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  39.33 
 
 
672 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  38.16 
 
 
679 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  37.15 
 
 
686 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  37.56 
 
 
663 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  36.64 
 
 
677 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  38.67 
 
 
706 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  38.82 
 
 
690 aa  449  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  37.28 
 
 
660 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  35.22 
 
 
639 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  35.24 
 
 
697 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  35.32 
 
 
680 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  35.09 
 
 
677 aa  425  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  34.9 
 
 
701 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  34.25 
 
 
653 aa  419  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  34.24 
 
 
657 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  34.93 
 
 
687 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  35.22 
 
 
682 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  34.26 
 
 
667 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  34.78 
 
 
685 aa  405  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  33.58 
 
 
667 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  33.04 
 
 
685 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  33.98 
 
 
682 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  34.75 
 
 
678 aa  389  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  34.11 
 
 
711 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  31.61 
 
 
686 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  34.67 
 
 
691 aa  381  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  32.99 
 
 
662 aa  379  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  33.28 
 
 
684 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  33.19 
 
 
678 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  34.55 
 
 
697 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  33.83 
 
 
671 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  34.67 
 
 
701 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  31.4 
 
 
687 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  33.14 
 
 
671 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  32.65 
 
 
681 aa  360  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  32.65 
 
 
663 aa  355  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  32.64 
 
 
685 aa  346  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  30.12 
 
 
669 aa  326  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  30.6 
 
 
670 aa  324  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  33.55 
 
 
710 aa  319  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  32.66 
 
 
649 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  32.51 
 
 
649 aa  309  9e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  34.24 
 
 
686 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  30.27 
 
 
644 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  28.25 
 
 
664 aa  280  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  28.21 
 
 
700 aa  278  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  27.72 
 
 
660 aa  267  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  28.21 
 
 
660 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  31.52 
 
 
609 aa  256  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  32.04 
 
 
714 aa  252  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  28.48 
 
 
661 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  27.57 
 
 
663 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  27.7 
 
 
646 aa  248  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  27.68 
 
 
663 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  28.11 
 
 
657 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  25.57 
 
 
673 aa  243  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  27.3 
 
 
664 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  27.15 
 
 
664 aa  240  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  27.15 
 
 
664 aa  240  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  28.65 
 
 
656 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  28.65 
 
 
656 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  27.19 
 
 
642 aa  236  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  27.36 
 
 
656 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  28.23 
 
 
652 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  29 
 
 
656 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  28.6 
 
 
635 aa  227  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  26.45 
 
 
645 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  27.01 
 
 
711 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  25.87 
 
 
710 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  26.47 
 
 
710 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  24.85 
 
 
635 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  27.93 
 
 
632 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  24.39 
 
 
701 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  23.54 
 
 
671 aa  191  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  24.92 
 
 
669 aa  188  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  26.13 
 
 
693 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  23.02 
 
 
674 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  22.78 
 
 
699 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  22.17 
 
 
715 aa  106  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.3 
 
 
699 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  20.28 
 
 
713 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2556  hypothetical protein  21.15 
 
 
1137 aa  50.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  37.84 
 
 
280 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>