More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0815 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 359 aa  707    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  41.49 
 
 		 335 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  41.49 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  23.7 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 379 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.25 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  25 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.2 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 549 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.62 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.09 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  25.8 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  25.25 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  25 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  23.3 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.24 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 537 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25.42 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.77 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  25.25 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  25.63 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  26.9 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  25.36 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 625 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  27.92 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  24.65 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  25.89 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  25.7 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.61 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  23.69 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  22.71 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  22.54 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  21.95 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  22.37 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  24.29 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  28.57 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  24.07 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  22.15 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.16 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  22.98 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  29.21 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  22.57 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.34 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  22.25 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  24.27 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.9 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  26.53 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  23.94 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>