More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0788 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 
98 aa  194  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  58.59 
 
 
101 aa  114  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  62.2 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  59.55 
 
 
100 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  59.55 
 
 
100 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  55 
 
 
100 aa  101  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 
98 aa  98.6  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  63.75 
 
 
97 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  55.56 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
94 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  53.57 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  51.81 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  51.06 
 
 
95 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  50.55 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
91 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  52.38 
 
 
93 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
91 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  50.6 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  60.26 
 
 
95 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  54.32 
 
 
95 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 
98 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  57.69 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  51.25 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  53.09 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  50.62 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  50.62 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.32 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  48.84 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 
96 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  53.09 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  51.81 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  47.42 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  51.16 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  48.78 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
95 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  48.15 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000650952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  41.76 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  36.08 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  50.59 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  43.33 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  47.5 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  44.58 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  47.5 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  45.68 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  41.86 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>