More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0781 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  100 
 
 
110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  50.53 
 
 
100 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  48.89 
 
 
99 aa  97.4  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  55.41 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  56.58 
 
 
86 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  53.57 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  52.38 
 
 
84 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  56.94 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 
84 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  55.56 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  54.29 
 
 
88 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  50.68 
 
 
90 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  51.32 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  50.68 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  54.67 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
82 aa  87  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
82 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
82 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
82 aa  87  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
82 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  54.29 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  48.08 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  48.05 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  48.05 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  50 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  50.62 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  48.61 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  47.95 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  54.29 
 
 
85 aa  84.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  50.67 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  50.67 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  54.29 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  47.37 
 
 
87 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
89 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  57.53 
 
 
85 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 
89 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  47.44 
 
 
88 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>