More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0621 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0621  patatin  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.84 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.39 
 
 		 760 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  28.78 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.97 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30.6 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.02 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.01 
 
 		 667 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  28.62 
 
 		 733 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  30.22 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  27.73 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  30.22 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.11 
 
 		 728 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.32 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30.56 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.06 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.21 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  34.05 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  29.88 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  30.19 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.45 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  26.85 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.27 
 
 		 728 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  30.22 
 
 		 750 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  29.08 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.92 
 
 		 728 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.16 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  29.78 
 
 		 777 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  32 
 
 		 327 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  31.34 
 
 		 740 aa  105  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.74 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.96 
 
 		 767 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.92 
 
 		 751 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.18 
 
 		 728 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  31.37 
 
 		 813 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  29.18 
 
 		 737 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  29.52 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.3 
 
 		 754 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.17 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  30.46 
 
 		 733 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  28.21 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.69 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  28.69 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  28.69 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.69 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  28.69 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  28.69 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  28 
 
 		 746 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  29.7 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  31.95 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  30.57 
 
 		 737 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  25.08 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  28.69 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  30.57 
 
 		 738 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  35.98 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  33.95 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.77 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.74 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  28.47 
 
 		 735 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  30.57 
 
 		 738 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.74 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  30.57 
 
 		 738 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  28.12 
 
 		 738 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  29.66 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.92 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  28.69 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  30.34 
 
 		 323 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.08 
 
 		 727 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.85 
 
 		 728 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  29.92 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.29 
 
 		 738 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  33.18 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.08 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.08 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  28.68 
 
 		 737 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.81 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.05 
 
 		 734 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.71 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.81 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  35.42 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.81 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.58 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  28.47 
 
 		 748 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.97 
 
 		 474 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  35.64 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  26.91 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  30.45 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  26.56 
 
 		 304 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  29.64 
 
 		 740 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.43 
 
 		 347 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  32.09 
 
 		 707 aa  99.4  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  35.6 
 
 		 347 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  28.68 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  28.68 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.18 
 
 		 798 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.18 
 
 		 796 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  28.68 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.63 
 
 		 311 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.37 
 
 		 349 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>