More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0568 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  100 
 
 
91 aa  183  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  74.71 
 
 
90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  74.71 
 
 
90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  72.84 
 
 
84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  65.43 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
89 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  57.47 
 
 
89 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  55.56 
 
 
91 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  60.24 
 
 
88 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 
89 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  54.65 
 
 
88 aa  103  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
89 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
89 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  59.26 
 
 
88 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 
89 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
91 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
89 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
91 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  55.81 
 
 
89 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
89 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
89 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  100  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  59.26 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
88 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
88 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  57.47 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  56.63 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  58.14 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  52.87 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  97.1  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  95.9  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  52.33 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  51.72 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  51.16 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  49.43 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  48.28 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  50 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  56.63 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  56.63 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  56.79 
 
 
87 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
88 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 
89 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 
89 aa  93.6  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0860  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 
87 aa  94  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>