More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0531 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0531  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 390 aa  796    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.077204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.16 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.62 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1333  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.89 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000335599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.6 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.5 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2715  ornithine decarboxylase  44.99 
 
 		 377 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3806  ornithine decarboxylase  45.05 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.16357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1080  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.77 
 
 		 376 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4547  ornithine decarboxylase  42.44 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3419  ornithine decarboxylase  42.41 
 
 		 380 aa  306  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3390  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.5 
 
 		 377 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.86 
 
 		 376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.82 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.41 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.215223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3689  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.24 
 
 		 377 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192406  normal  0.735507 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0100  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  44.41 
 
 		 377 aa  302  8.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.938006  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0092  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  44.41 
 
 		 377 aa  302  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1349  ornithine decarboxylase  43.98 
 
 		 380 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0938  Ornithine decarboxylase  41.62 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4837  ornithine decarboxylase  41.91 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4245  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.05 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0856  ornithine decarboxylase  42.27 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  40.59 
 
 		 389 aa  295  6e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0801  ornithine decarboxylase  41.94 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2772  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.87 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  43.78 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1090  pyridoxal-dependent decarboxylase  42.97 
 
 		 377 aa  293  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0576  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.63 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58630  ornithine decarboxylase  41.64 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  41.42 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  41.18 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5135  ornithine decarboxylase  41.38 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  41.01 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  41.07 
 
 		 387 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  41.02 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4655  ornithine decarboxylase  42.66 
 
 		 388 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.203932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  41.18 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2045  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.23 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  41.69 
 
 		 391 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2320  Ornithine decarboxylase  41.96 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  0.55371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0446  ornithine decarboxylase  42.09 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  40.58 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2006  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.58 
 
 		 388 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1649  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.94 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.648031  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  41 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0410  ornithine decarboxylase  41.82 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2177  ornithine decarboxylase  39.63 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.024937  normal  0.209204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3392  ornithine decarboxylase  40.75 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000026968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  41.11 
 
 		 359 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0029  ornithine decarboxylase  38.46 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0541  diaminopimelate decarboxylase  39.68 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0699456  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0037  ornithine decarboxylase  38.1 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0465  diaminopimelate decarboxylase  39.15 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0489  Diaminopimelate decarboxylase  39.15 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3854  diaminopimelate decarboxylase  39.15 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000739123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4136  decarboxylase, pyridoxal-dependent  39.52 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2057  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.06 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0486  diaminopimelate decarboxylase  39.52 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000602971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3405  diaminopimelate decarboxylase  41.29 
 
 		 391 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1693  ornithine decarboxylase  43.43 
 
 		 421 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3075  diaminopimelate decarboxylase  39.78 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000605202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0445  ornithine decarboxylase  39.25 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00713541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0801  ornithine decarboxylase  38.84 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3110  ornithine decarboxylase  39.07 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3507  ornithine decarboxylase  38.73 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00021864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.15 
 
 		 391 aa  266  7e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3682  ornithine decarboxylase  38.71 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00110632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2180  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.5 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0693915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  38.8 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  38.46 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24620  ornithine decarboxylase  37.7 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5654  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.67 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.89 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  34.21 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.63 
 
 		 397 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3803  Ornithine decarboxylase  28.34 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.390604  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2447  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.9 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.32 
 
 		 379 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.18 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03846  ornithine decarboxylase (Eurofung)  29.38 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000212473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04890  ornithine decarboxylase, putative  29.75 
 
 		 527 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.447794  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12642  ornithine decarboxylase 2  29.29 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0377  ornithine decarboxylase  29.87 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.412388  normal  0.928081 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90612  ornithine decarboxylase  27.76 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.253647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2321  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.19 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671563  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3089  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.63 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  28.73 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  26.29 
 
 		 420 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0701  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.84 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  28.25 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1991  putative ornithine decarboxylase  28.84 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  25.39 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31322  Ornithine decarboxylase  28 
 
 		 547 aa  139  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0025491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  26.55 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  25.39 
 
 		 417 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  28.26 
 
 		 457 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  26.56 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  27.51 
 
 		 412 aa  132  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>