186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0454 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  639    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  47.21 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  43.48 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  41.25 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  39.56 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  39.93 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.15 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  39.79 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  38.04 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  35.24 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  44.08 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  36.45 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  34.36 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.5 
 
 		 680 aa  185  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  32.9 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  35.06 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  37.26 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  37.1 
 
 		 237 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  35.51 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  34.85 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  29.64 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  29.28 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  33.47 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  34.45 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  32.86 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  27.13 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.3 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.38 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  26.57 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.11 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.56 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  29.77 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.57 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.51 
 
 		 373 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.86 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.21 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.84 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.12 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.12 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.66 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  28.26 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.17 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  28.24 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.14 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.63 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.83 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.83 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.22 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2864  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.75 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.45 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.63 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.62 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2803  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000449435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 373 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0519  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2492  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0107198  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00347388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1815  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>