More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0434 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
154 aa  302  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
154 aa  302  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  46.38 
 
 
145 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
158 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  45.04 
 
 
150 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 
153 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  41.41 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 
163 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
169 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
161 aa  93.6  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  42.4 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  40.3 
 
 
150 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
202 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
235 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
160 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
165 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 
154 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  39.85 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  42.64 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
161 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  36.17 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
169 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 
166 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  40.57 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.03 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  36.88 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 
206 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  30.12 
 
 
211 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  32.7 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  36.64 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  32.35 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  37.21 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>