More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0428 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  62.96 
 
 
520 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  63.65 
 
 
519 aa  727    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  94.06 
 
 
522 aa  1024    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  63.34 
 
 
521 aa  719    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
522 aa  1074    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  54.53 
 
 
519 aa  621  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.06 
 
 
553 aa  444  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  43.96 
 
 
526 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  40.93 
 
 
543 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  38.49 
 
 
523 aa  313  6.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  38.49 
 
 
523 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  41.47 
 
 
523 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  36.1 
 
 
518 aa  302  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  36.96 
 
 
535 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  43.88 
 
 
442 aa  299  9e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  35.56 
 
 
526 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  41.83 
 
 
523 aa  296  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 
522 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  45.76 
 
 
429 aa  290  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  35.74 
 
 
522 aa  287  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  39.39 
 
 
534 aa  280  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  35.5 
 
 
606 aa  270  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  35.5 
 
 
606 aa  270  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  33.4 
 
 
539 aa  264  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  43.4 
 
 
430 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.55 
 
 
506 aa  254  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  38.9 
 
 
552 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  39.47 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  38.66 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  33.49 
 
 
547 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  41.81 
 
 
342 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  31.28 
 
 
558 aa  155  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1669  DNA recombinase, putative  43.64 
 
 
165 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.23 
 
 
515 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  30.88 
 
 
498 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.83 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  31.23 
 
 
479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.97 
 
 
613 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.72 
 
 
487 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.5 
 
 
542 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.5 
 
 
542 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.5 
 
 
542 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  32.6 
 
 
321 aa  137  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.36 
 
 
496 aa  133  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.12 
 
 
509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.16 
 
 
415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.55 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.34 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.55 
 
 
665 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  30.32 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.29 
 
 
537 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  30.29 
 
 
489 aa  125  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  30.48 
 
 
535 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  31.83 
 
 
539 aa  123  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.44 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.64 
 
 
475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  29.63 
 
 
517 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.07 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  28 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.65 
 
 
500 aa  118  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.64 
 
 
445 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.25 
 
 
484 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 
546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  31.08 
 
 
462 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  29.55 
 
 
541 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.31 
 
 
515 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  26.17 
 
 
541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.98 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.84 
 
 
546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.22 
 
 
441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  24.51 
 
 
460 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  28.08 
 
 
528 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.73 
 
 
525 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  30.2 
 
 
462 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.22 
 
 
527 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.82 
 
 
528 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 
445 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.83 
 
 
447 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.05 
 
 
343 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.71 
 
 
525 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 
549 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.84 
 
 
537 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 
445 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  25.12 
 
 
500 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  29.87 
 
 
459 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  27 
 
 
441 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  27.96 
 
 
272 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.83 
 
 
475 aa  104  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  31.91 
 
 
295 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 
504 aa  104  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 
485 aa  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
580 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.85 
 
 
547 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.86 
 
 
534 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.61 
 
 
662 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 
586 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.86 
 
 
534 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.09 
 
 
534 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.6 
 
 
441 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>