256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0407 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
338 aa  697    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4803  DNA methylase  60.44 
 
 
322 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.9 
 
 
330 aa  319  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  48.53 
 
 
301 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.28 
 
 
394 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.41 
 
 
874 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.21 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.44 
 
 
329 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.74 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.29 
 
 
345 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.84 
 
 
313 aa  222  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.12 
 
 
412 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4481  DNA methylase N-4/N-6  28.21 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5389  DNA methylase N-4/N-6  24.76 
 
 
355 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.352939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0277  hypothetical protein  27.09 
 
 
413 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.294361  normal  0.0427595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.09 
 
 
597 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.19 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.45 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.17 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.17 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.18 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.17 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.26 
 
 
274 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.33 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.45 
 
 
222 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  36.08 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  36.08 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.35 
 
 
255 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1221  modification methylase, putative  40.91 
 
 
204 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000763333  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6265  hypothetical protein  48 
 
 
80 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  38.89 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.74 
 
 
313 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  46.3 
 
 
239 aa  56.6  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.63 
 
 
403 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.89 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2756  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.79 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.06 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.63 
 
 
553 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.3 
 
 
382 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.06 
 
 
304 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.06 
 
 
332 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.15 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.59 
 
 
396 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.19 
 
 
266 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 
849 aa  52.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  43.94 
 
 
294 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  35.29 
 
 
542 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1954  DNA methylase  40 
 
 
282 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000695995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.28 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.06 
 
 
308 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.06 
 
 
308 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  40.3 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  36.47 
 
 
567 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2574  adenine specific DNA methylase Mod  36.27 
 
 
692 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  48.15 
 
 
368 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.3 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.89 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  42.59 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  33.96 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.52 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.62 
 
 
399 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  40.62 
 
 
432 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.51 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.42 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  39.74 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  44.44 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  31.19 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.43 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  42.42 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.37 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  22.27 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  32.09 
 
 
779 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.3 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  24.1 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.74 
 
 
158 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.902503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.38 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  44.44 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0342  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.48 
 
 
581 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.1 
 
 
464 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.59 
 
 
379 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.74 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0731  type III restriction/modification enzyme, methylase subunit  51.06 
 
 
675 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.89 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.98 
 
 
225 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.58 
 
 
540 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.18 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.94 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>