More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0320 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  100 
 
 
111 aa  226  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  61.96 
 
 
95 aa  124  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  61.96 
 
 
95 aa  124  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  59.78 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  53.49 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 
91 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  55.17 
 
 
90 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 
88 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  49.45 
 
 
96 aa  105  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 
88 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  52.87 
 
 
90 aa  104  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  51.16 
 
 
90 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  51.72 
 
 
90 aa  103  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  50.59 
 
 
139 aa  103  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 
88 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  53.09 
 
 
90 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
89 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 
183 aa  98.2  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  51.65 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 
91 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 
81 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 
91 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  50.63 
 
 
96 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 
81 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  43.68 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  55 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  50.57 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 
86 aa  94.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  49.4 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
146 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  55 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
87 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  53.85 
 
 
85 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
81 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 
197 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  51.85 
 
 
191 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  50.63 
 
 
191 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 
188 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
204 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 
86 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  45.56 
 
 
93 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  48.1 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  46.15 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  48.65 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
81 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
81 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  49.37 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 
122 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  46.84 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 
133 aa  84.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  44.3 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  48.68 
 
 
86 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  48.68 
 
 
86 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
192 aa  83.6  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  41.86 
 
 
88 aa  83.6  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 
175 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0881  ribosomal protein S16  52.63 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000838528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  47.3 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  41.77 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  49.35 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  39.58 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  43.9 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  45.68 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>