More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0303 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3175  putative transcriptional regulator, GntR family  26.01 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.21 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2101  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  26.49 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  23.96 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.06 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0563  putative transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  26.01 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  22.45 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  26.16 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  30.1 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>