More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0279 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  100 
 
 
445 aa  876    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  61.71 
 
 
445 aa  567  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  39.04 
 
 
453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  38.55 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  37.64 
 
 
450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  36.45 
 
 
460 aa  277  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  36.22 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  36.22 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  35.24 
 
 
479 aa  249  8e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  32.08 
 
 
449 aa  249  9e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  33.85 
 
 
453 aa  244  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  34.74 
 
 
459 aa  242  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  31.38 
 
 
458 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  31.38 
 
 
458 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
455 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  32.96 
 
 
458 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  33.56 
 
 
458 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  33.33 
 
 
458 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  28.92 
 
 
461 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  29.31 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  30.7 
 
 
460 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  29.16 
 
 
456 aa  210  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  30.97 
 
 
454 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25 
 
 
484 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  28.01 
 
 
461 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  26.58 
 
 
456 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
463 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
472 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
442 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
453 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.28 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  22.27 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
464 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.06 
 
 
464 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.06 
 
 
464 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
464 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
464 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.63 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  25.51 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.86 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  22.47 
 
 
461 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  21.66 
 
 
450 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
450 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.07 
 
 
440 aa  123  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.95 
 
 
445 aa  123  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  22.5 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.16 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.94 
 
 
547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.94 
 
 
547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.94 
 
 
546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.28 
 
 
495 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.48 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.94 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.94 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  28.07 
 
 
449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.39 
 
 
464 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
464 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  21.49 
 
 
450 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
446 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  23.72 
 
 
439 aa  113  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.75 
 
 
462 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  26.45 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
461 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
475 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.29 
 
 
468 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.86 
 
 
468 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  23.97 
 
 
446 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  28.64 
 
 
468 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
483 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  26.04 
 
 
466 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.21 
 
 
450 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
469 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  23.81 
 
 
440 aa  106  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  23.84 
 
 
484 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  28.39 
 
 
468 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  25.16 
 
 
500 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  28.39 
 
 
468 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  28.39 
 
 
468 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  28.39 
 
 
468 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  28.39 
 
 
468 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  22.4 
 
 
474 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  20.36 
 
 
445 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
475 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  22.4 
 
 
474 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  24.26 
 
 
481 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  22.65 
 
 
459 aa  103  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  23.8 
 
 
446 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  28.14 
 
 
468 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  23.94 
 
 
480 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>