More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0253 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  37.66 
 
 
228 aa  165  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  39.21 
 
 
229 aa  156  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.24 
 
 
231 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.39 
 
 
232 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.75 
 
 
229 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.09 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  33.19 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.58 
 
 
234 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  30.26 
 
 
225 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.84 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  30.26 
 
 
225 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  30.13 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.7 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  32.35 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  32.02 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  32.35 
 
 
238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  32.35 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  30 
 
 
233 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  31.3 
 
 
226 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  29.82 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  29.82 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  29.39 
 
 
225 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.39 
 
 
225 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  29.39 
 
 
225 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  29.39 
 
 
225 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.39 
 
 
225 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  31.44 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  31.44 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  29.39 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  31.44 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.28 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  32.02 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  31.28 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  30.43 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  31.14 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  28.51 
 
 
225 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  28.51 
 
 
225 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  28.51 
 
 
225 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  28.51 
 
 
225 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  28.51 
 
 
225 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  30.26 
 
 
224 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  30.13 
 
 
224 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  31.58 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  28.26 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  29.39 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  30.64 
 
 
226 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  29.54 
 
 
224 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.67 
 
 
254 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  33.66 
 
 
221 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.84 
 
 
231 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  32.2 
 
 
236 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  30.26 
 
 
230 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  27.12 
 
 
228 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
225 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  29.82 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
225 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.51 
 
 
225 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  25.55 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.35 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.57 
 
 
236 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.09 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.03 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.49 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  31.03 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  31.03 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  30.54 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  29.86 
 
 
231 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.08 
 
 
233 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  30.54 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  30.54 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.54 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.39 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  30.88 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  30.39 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.86 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.19 
 
 
227 aa  92  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  30.39 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  30.39 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.82 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28.02 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  26.84 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.71 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  28.16 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25.96 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  28.87 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.38 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  25.66 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.17 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  28.37 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>