286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0239 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
516 aa  1041    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  62.62 
 
 
508 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  54.65 
 
 
507 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  54.33 
 
 
509 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  53.56 
 
 
511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  56.28 
 
 
507 aa  551  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  53.99 
 
 
508 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  53.02 
 
 
505 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  53.02 
 
 
505 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  53.02 
 
 
505 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  53.02 
 
 
505 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  52.82 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  53.02 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  52.82 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  52.82 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  53.67 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  52.82 
 
 
506 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  53.02 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  50.5 
 
 
498 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  52.8 
 
 
504 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  49.13 
 
 
520 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 
516 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  49.7 
 
 
506 aa  478  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  49.6 
 
 
506 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  47.67 
 
 
526 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  47.7 
 
 
528 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  47.83 
 
 
508 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  48.02 
 
 
508 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  46.52 
 
 
538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  48.02 
 
 
508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  46.53 
 
 
523 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  46.9 
 
 
528 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  49.22 
 
 
489 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  45.25 
 
 
511 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  45.33 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  44.12 
 
 
514 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  44.95 
 
 
511 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
506 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
506 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
506 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
506 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  43.85 
 
 
511 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  43.97 
 
 
524 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
497 aa  433  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  41.89 
 
 
536 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  44.65 
 
 
513 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  44.65 
 
 
513 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  47.63 
 
 
510 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  46.22 
 
 
507 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 
511 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
513 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 
506 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
513 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  43.95 
 
 
510 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
513 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  44.6 
 
 
515 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  45.22 
 
 
513 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  44.95 
 
 
510 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  46.33 
 
 
499 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4004  histidine ammonia-lyase  41.98 
 
 
537 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187247  normal  0.249864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  44.33 
 
 
513 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
513 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
513 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  47.54 
 
 
503 aa  425  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
513 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.1 
 
 
510 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  46.92 
 
 
510 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  46.71 
 
 
510 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  44.33 
 
 
515 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  47.93 
 
 
517 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  44.85 
 
 
510 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 
509 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  46.71 
 
 
510 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 
509 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  44.12 
 
 
510 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  44.84 
 
 
514 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  48.56 
 
 
505 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  44.1 
 
 
510 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  46.5 
 
 
510 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
512 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  42.51 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  45.93 
 
 
506 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  46.04 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  46.44 
 
 
506 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  45.67 
 
 
511 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  43.06 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  46.22 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  47.29 
 
 
507 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  45.79 
 
 
507 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  44.08 
 
 
507 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
511 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  47.18 
 
 
507 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  47.29 
 
 
507 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  47.29 
 
 
507 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  47.18 
 
 
533 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  47.29 
 
 
507 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  47.18 
 
 
529 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.88 
 
 
507 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>