162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0231 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  55.51 
 
 		 1059 aa  1160    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1041 aa  2116    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  55.42 
 
 		 1059 aa  1158    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  51.24 
 
 		 1020 aa  1034    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  50.3 
 
 		 1037 aa  993    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.59 
 
 		 697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.3 
 
 		 1018 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  36.6 
 
 		 689 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  33.87 
 
 		 1019 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  61.61 
 
 		 1478 aa  426  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.89 
 
 		 1780 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  30.85 
 
 		 1215 aa  349  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.97 
 
 		 1331 aa  331  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.99 
 
 		 1146 aa  325  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.95 
 
 		 1050 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  48.48 
 
 		 323 aa  301  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  34.18 
 
 		 690 aa  295  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  28.69 
 
 		 912 aa  291  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  45.19 
 
 		 366 aa  287  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  34.97 
 
 		 756 aa  287  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  37.17 
 
 		 619 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  43.03 
 
 		 331 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.89 
 
 		 1495 aa  273  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  44.55 
 
 		 359 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  40.12 
 
 		 338 aa  263  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  38.23 
 
 		 423 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  41.8 
 
 		 324 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  43.56 
 
 		 321 aa  256  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  38.08 
 
 		 374 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  39.73 
 
 		 407 aa  243  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  39.51 
 
 		 337 aa  243  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  38.12 
 
 		 382 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  25.65 
 
 		 1242 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  42.72 
 
 		 347 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  35.96 
 
 		 806 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  42.38 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  35.18 
 
 		 837 aa  211  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  38.22 
 
 		 457 aa  210  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  34.49 
 
 		 370 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 1077 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  37.94 
 
 		 333 aa  198  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  33.81 
 
 		 369 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  38.14 
 
 		 491 aa  197  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  37.18 
 
 		 371 aa  197  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  35.83 
 
 		 2457 aa  196  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  37.1 
 
 		 495 aa  191  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  34.08 
 
 		 497 aa  191  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  36.91 
 
 		 423 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  36.66 
 
 		 474 aa  187  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  53.48 
 
 		 215 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  35.82 
 
 		 503 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  36.28 
 
 		 619 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  35 
 
 		 488 aa  182  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.17 
 
 		 815 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 678 aa  182  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  33.44 
 
 		 477 aa  181  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.18 
 
 		 328 aa  178  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.47 
 
 		 820 aa  177  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  34.69 
 
 		 463 aa  177  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  35.95 
 
 		 474 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  35.95 
 
 		 364 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  36.16 
 
 		 829 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 		 628 aa  175  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  34.99 
 
 		 389 aa  173  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  32.34 
 
 		 472 aa  171  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.76 
 
 		 778 aa  171  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  33.65 
 
 		 487 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.35 
 
 		 490 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  34.34 
 
 		 375 aa  168  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  34.2 
 
 		 1001 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  32.37 
 
 		 370 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  34.63 
 
 		 309 aa  163  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  36.53 
 
 		 399 aa  163  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  30.82 
 
 		 373 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  32.9 
 
 		 454 aa  162  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  34.46 
 
 		 451 aa  162  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  34.25 
 
 		 383 aa  161  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  32.89 
 
 		 388 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  33.98 
 
 		 756 aa  160  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  34.92 
 
 		 317 aa  160  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  33.55 
 
 		 457 aa  156  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  32.09 
 
 		 376 aa  154  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  41.29 
 
 		 2286 aa  154  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  33.76 
 
 		 543 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  32.33 
 
 		 394 aa  151  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  29 
 
 		 486 aa  151  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  29.77 
 
 		 465 aa  148  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  30.77 
 
 		 520 aa  147  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  30.19 
 
 		 387 aa  147  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  33.46 
 
 		 321 aa  147  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 		 398 aa  144  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  30.39 
 
 		 370 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  29.1 
 
 		 373 aa  140  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  30.87 
 
 		 357 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  30.29 
 
 		 401 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  28.67 
 
 		 566 aa  138  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  30.08 
 
 		 392 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  41.94 
 
 		 691 aa  137  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 639 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>