More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0229 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  52.13 
 
 
790 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  54.58 
 
 
772 aa  845    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.94 
 
 
795 aa  722    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.46 
 
 
762 aa  858    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.88 
 
 
755 aa  647    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
777 aa  1589    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.84 
 
 
771 aa  810    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 
805 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.86 
 
 
782 aa  808    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  58.65 
 
 
778 aa  932    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  58.52 
 
 
778 aa  929    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.69 
 
 
760 aa  634  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.35 
 
 
783 aa  626  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  41.19 
 
 
788 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.47 
 
 
756 aa  608  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.66 
 
 
807 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.6 
 
 
760 aa  600  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.42 
 
 
773 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  38.19 
 
 
817 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  41 
 
 
802 aa  588  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.62 
 
 
785 aa  571  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.37 
 
 
792 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  40.61 
 
 
808 aa  568  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.01 
 
 
784 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.84 
 
 
771 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.33 
 
 
760 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.39 
 
 
806 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.72 
 
 
791 aa  548  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.87 
 
 
769 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.53 
 
 
768 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  37.78 
 
 
811 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.77 
 
 
798 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.06 
 
 
778 aa  542  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.38 
 
 
790 aa  535  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.63 
 
 
807 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.65 
 
 
902 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.61 
 
 
803 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.66 
 
 
809 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  37.52 
 
 
789 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  38.1 
 
 
1037 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 
811 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.37 
 
 
813 aa  509  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.8 
 
 
760 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.98 
 
 
757 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  37.45 
 
 
743 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.72 
 
 
754 aa  489  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.22 
 
 
751 aa  485  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  36.83 
 
 
859 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  37.12 
 
 
721 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 
751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  36.59 
 
 
737 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.4 
 
 
799 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.21 
 
 
804 aa  469  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.01 
 
 
801 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 
766 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  37.17 
 
 
739 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  36.71 
 
 
740 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  35.76 
 
 
743 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  36.09 
 
 
772 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  36.86 
 
 
765 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  36.03 
 
 
727 aa  452  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  36.16 
 
 
727 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  35.92 
 
 
766 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  36.82 
 
 
759 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  35.44 
 
 
774 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 
762 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 
738 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  35.82 
 
 
750 aa  442  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.35 
 
 
738 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.59 
 
 
769 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  35.92 
 
 
765 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.33 
 
 
769 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  35.71 
 
 
759 aa  436  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  35.57 
 
 
753 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.38 
 
 
702 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  35.46 
 
 
743 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  36.63 
 
 
763 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  36 
 
 
723 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.91 
 
 
752 aa  432  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  35.84 
 
 
763 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  34.2 
 
 
755 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  34.59 
 
 
765 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.39 
 
 
733 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  34.46 
 
 
755 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  34.07 
 
 
755 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  34.2 
 
 
755 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  35.57 
 
 
763 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  33.29 
 
 
793 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 
764 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  34.56 
 
 
768 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  37.01 
 
 
759 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  35.57 
 
 
763 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.07 
 
 
765 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  34.07 
 
 
765 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  34.07 
 
 
765 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.97 
 
 
768 aa  422  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  34.07 
 
 
765 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  33.94 
 
 
765 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  35.89 
 
 
764 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  33.94 
 
 
765 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>