238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0182 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0182  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  651    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0099  ribokinase-like domain-containing protein  44.65 
 
 
319 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0099  ribokinase-like domain-containing protein  44.34 
 
 
319 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0676  ribokinase-like domain-containing protein  44.94 
 
 
317 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0971  ribokinase-like domain-containing protein  38.92 
 
 
318 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  31.96 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.53 
 
 
320 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  30.38 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.03 
 
 
310 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  30.25 
 
 
319 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 
303 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.2 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  30.46 
 
 
303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  31.63 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 
305 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  29.02 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  30.63 
 
 
310 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.14 
 
 
303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.52 
 
 
308 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  31.31 
 
 
303 aa  122  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  25.88 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  29.33 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  28.66 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  29.89 
 
 
311 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  28.52 
 
 
314 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  28.66 
 
 
310 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  29.18 
 
 
312 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  27.86 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  27.53 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.79 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  29.15 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.97 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  30.28 
 
 
306 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  26.38 
 
 
316 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  30.45 
 
 
310 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 
303 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  27.41 
 
 
316 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  25.25 
 
 
315 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.19 
 
 
310 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  25.25 
 
 
314 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  28.71 
 
 
307 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  28.52 
 
 
338 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 
316 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  29.18 
 
 
312 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  27.22 
 
 
304 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  25.31 
 
 
318 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  27.07 
 
 
307 aa  107  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  27.21 
 
 
310 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  23.2 
 
 
326 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  23.25 
 
 
310 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  23.25 
 
 
310 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  25.62 
 
 
318 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.33 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  26.09 
 
 
310 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  26.09 
 
 
310 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  28.75 
 
 
311 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  29.84 
 
 
302 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 
300 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  26.1 
 
 
315 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  26.41 
 
 
315 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  25.8 
 
 
308 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  26.56 
 
 
315 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  30.52 
 
 
303 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.23 
 
 
306 aa  102  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  26.39 
 
 
314 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  24.38 
 
 
318 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  25 
 
 
334 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
336 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  21.9 
 
 
311 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  26.55 
 
 
315 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.7 
 
 
305 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  25.82 
 
 
313 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  26.77 
 
 
310 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  28.43 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  26.18 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  26.91 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  26.91 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  28.83 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  24.46 
 
 
318 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  26.39 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  25.18 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  25.7 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  26.17 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  26.5 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  27.44 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  23.53 
 
 
311 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  23.53 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  23.7 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  24.43 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  26.19 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  28.37 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  28.37 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>