More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0177 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 		 635 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  51.63 
 
 		 642 aa  639    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  55.3 
 
 		 640 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  51.01 
 
 		 633 aa  657    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  52.66 
 
 		 638 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  52.81 
 
 		 633 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  51.41 
 
 		 636 aa  663    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  53.2 
 
 		 633 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.4 
 
 		 650 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  51.62 
 
 		 637 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  57.97 
 
 		 650 aa  721    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  52.27 
 
 		 642 aa  641    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  51.31 
 
 		 649 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  50.78 
 
 		 634 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  59.65 
 
 		 627 aa  759    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  51.25 
 
 		 632 aa  644    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  59.43 
 
 		 636 aa  773    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  59.12 
 
 		 636 aa  769    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  51.79 
 
 		 640 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  55.61 
 
 		 640 aa  660    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.94 
 
 		 633 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.47 
 
 		 640 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  50.78 
 
 		 644 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.96 
 
 		 637 aa  659    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 		 628 aa  649    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  51.39 
 
 		 649 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 641 aa  1305    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  52.09 
 
 		 644 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.62 
 
 		 644 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  48.83 
 
 		 637 aa  634  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  51.41 
 
 		 641 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  51.94 
 
 		 643 aa  634  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  51.41 
 
 		 635 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  52.35 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.57 
 
 		 640 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  53.03 
 
 		 640 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  53.26 
 
 		 640 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  51.31 
 
 		 644 aa  628  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 640 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  53.42 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  51.42 
 
 		 636 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  52.09 
 
 		 643 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  51.32 
 
 		 642 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  48.3 
 
 		 647 aa  620  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  51.41 
 
 		 637 aa  619  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  49.22 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  49.08 
 
 		 655 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  47.98 
 
 		 635 aa  613  9.999999999999999e-175  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  49.53 
 
 		 642 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  49.53 
 
 		 642 aa  610  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  49.24 
 
 		 655 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  49 
 
 		 652 aa  608  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  49.37 
 
 		 642 aa  609  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  49.53 
 
 		 647 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  48.31 
 
 		 655 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  48.63 
 
 		 655 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  47.66 
 
 		 644 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  50.93 
 
 		 638 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  51.09 
 
 		 652 aa  607  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  47.76 
 
 		 665 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  48.73 
 
 		 660 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  48.46 
 
 		 655 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  47.74 
 
 		 634 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  50.78 
 
 		 638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  48.64 
 
 		 658 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  48.55 
 
 		 650 aa  599  1e-170  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  49.14 
 
 		 638 aa  599  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  48.93 
 
 		 644 aa  601  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  47.79 
 
 		 655 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  48.51 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  50.69 
 
 		 642 aa  597  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  48.07 
 
 		 655 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  50.23 
 
 		 641 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  45.21 
 
 		 675 aa  595  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  49.61 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  50.23 
 
 		 641 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  48.06 
 
 		 651 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  48.38 
 
 		 655 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  46.26 
 
 		 686 aa  592  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  47.79 
 
 		 651 aa  592  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  47.46 
 
 		 648 aa  594  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  50.62 
 
 		 649 aa  593  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  48.22 
 
 		 655 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  47.22 
 
 		 659 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  48.48 
 
 		 648 aa  590  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 		 672 aa  591  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  50.16 
 
 		 650 aa  590  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  46.21 
 
 		 656 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  47.52 
 
 		 654 aa  587  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  48.34 
 
 		 643 aa  586  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  48.98 
 
 		 650 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  46.5 
 
 		 637 aa  585  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 642 aa  585  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>